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生態学会の反省

2010.03.16 Tuesday

昨日今日と，東京で開催されている生態学会に参加してきました．

2006年の新潟大会以降，久しぶりの参加でした．

昨日は，自由集会「シロアリの生態学ーカースト分化と共生システムをめぐってー」に参加．

今日は，シンポジウム「迅速な適応性（第２回）ー学習や表現型可塑性がドライブする進化」に企画者として参加しました．

両集会とも，講演をさせていただきましたが，自分的には，ストーリーの構築や，話の盛り込み方など，反省材料の多い講演となってしまいました．お聞き苦しいところが多々あったかと思います．

特に今日の講演は，学生などにはいつも言っているのですが，問題提起（作業仮説）が明確でなく，枚挙的になってしまいました．総説的なことを言おうとする場合，case studyを列挙せざるを得ない部分もありますが，メッセージが聴衆に伝わるように工夫が必要です．

いつもは学会発表が終わると，余り反省ということもしませんでしたが，これからは少し反省していかないと，と思いました．この年になり，教官ともなると，苦言を呈してくれる人もいなくなってきますので．

21:55 | 学会 | posted by polyphenism

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ニャン君の弟

2010.03.01 Monday

突然ですが，ニャン君に弟ができました．

21:49 | mammals | posted by polyphenism

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Aphid Genome!

2010.02.24 Wednesday

やっとエンドウヒゲナガアブラムシ Acyrthosiphon pisum のゲノム解読を報告する論文がPLoS Biologyに出ました！

The International Aphid Genomics Consortium (2010)

Genome Sequence of the Pea Aphid Acyrthosiphon pisum.

PLoS Biology 8(2): e1000313. doi:10.1371/journal.pbio.1000313

私もこの論文に少しだけ関わりました．もちろん害虫のゲノム，ということで応用的にも非常に価値のあるものですが，論文にもある通り，初めての不完全変態昆虫である点や，様々な表現型多型を示す点，そして様々な遺伝子で重複や欠失が見られるのも興味深いです．

我々は可塑性の研究をしており，遺伝子発現解析なども行っているので，ゲノム情報は研究を進める上で極めて強力な武器となります．また，アブラムシの研究のみならず，シロアリなどの不完全変態昆虫から遺伝子をクローニングしたりするときも，とても役に立ちます．

プレスリリース記事はこちらです．

世界的な農業害虫「アブラムシ」のゲノム解読に成功

ーユニークな昆虫のユニークな遺伝子レパートリーを解明ー

さらに．．．

Insect Molecular Biologyの特別号が，関連論文の特集号となっています．

Insect Molecular Biology

Volume 19 Issue s2 (March 2010)

Special Issue: The Aphid Genome

08:54 | 論文 | posted by polyphenism

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Shaun White Gold!

2010.02.18 Thursday

予想通り、ショーン・ホワイトがゴールドメダルを獲得しました。

生で見ることはできませんでしたが、帰宅後、大画面で何度も、ショーンのウィニングランを見てしまいました。

何度見てもカッコイイ！ダブルコークもダブルマック1260も完璧。メディアでも言われてる通り、異次元の滑りを見せてくれました。

TVではショーンと日本の選手しか見せてくれませんでしたが、その他の選手の滑りも見てみたかったです。

今回のrunはまだネット上では見れないようですが、下記でShaunの滑りが見れます。

そしてこれはだぶるコークを練習している様子。

こんなプライベートなパイプで練習できる環境も凄い。

今回のオリンピックで一番見たかったのが彼の滑りでした。

もちろん日本選手の活躍にも期待しています！

23:29 | snowboard | posted by polyphenism

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富山も大雪

2010.02.16 Tuesday

出張で富山に来ております．

富山大での修士論文審査を昨日に，そして今日はセミナーをさせてもらいました．どちらも楽しませてもらいました．富山大の学生も原基がよくてよかった．

こっちにつくと意外と雪が積もっており，びっくりしました．が，札幌の雪とは降り方も雪質も大分違うし，気温も雪対策も色々違ってさらに驚きです．雪は湿っていて，濡れます．

こちらは道路の融雪は水でやっています．北海道でそんなことをしたら道路があっという間に凍ってしまいそうです．

そして，道路脇には下記のようなスコップが設置されているところがあり，「ひとかき運動」という雪かき推奨運動がされています．

現在富山空港で，帰りの飛行機を待っていたのですが，ここに来てまた大雪．なんと札幌便は欠航になってしまいました！！！

羽田経由の便に振り替えましたが，本日中に札幌に帰れるのだろうか．．．

とりあえず，ホスピタリテムテムは原基です！

【追記】

結局，富山を本日出発する全ての便が欠航となり，富山にもう一泊することが決定．

明日は北大での修論発表なので，昼までには何としてでも帰らなくてはならないのだが．．．

最悪です

16:56 | 研究 | posted by polyphenism

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Magic Mouse

2010.02.09 Tuesday

Apple Magic Mouse なるものを買ってみた．

ワイヤレスなので，USBかなんかさして認識させるのかと思ったら，Bluetoothってヤツで自動で認識されるらしい．しかも表面がセンサーになっていてスクロールとかもできる．マルチタッチジェスチャーにも対応，とのこと．

ツルッとしたデザインなのに，設定すれば，右クリックもできます．

ホントよくできています．

21:57 | 日記 | posted by polyphenism

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EvoDevo

2010.02.01 Monday

Bio Med Central からこんなジャーナルが刊行されることになっているそうです！

これまでEvo-Devo関連のジャーナルと言えば，

Evolution & Development

Development, Genes and Evolution

Journal of Experimental Zoology B: Molecular and Developmental Evolution

の３誌でしたが、新たに１誌加わることに．．．

今準備中のどれかを是非投稿したいものです。

どんな雑誌になるのか、楽しみです。

23:41 | 論文 | posted by polyphenism

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iPad

2010.01.29 Friday

そろそろ iPhone に変えようかと思っていた矢先，

こんなものが出やがりましたね！

ブラウザを見るにはいいいだろうけど，携帯の代わりにはならんよね．そのうち日本でも発売になるんでしょうけど，次々とこのようなデバイスが進化するのは面白いですね．

00:11 | 日記 | posted by polyphenism

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From polyphenism to complex metazoan life cycles

2010.01.21 Thursday

今日知ったのですが，最新の Phil. Trans. R. Soc. B の特集は polyphenism ということで，ほぼ全ての論文が must read！（汗）

なので，リンクと，目次をとりあえず張っておきます．

theme issue 'from polyphenism to complex metazoan life cycles' compiled and edited by giuseppe fusco and alessandro minelli

Giuseppe Fusco and Alessandro Minelli

Phenotypic plasticity in development and evolution: facts and concepts

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:547-556; doi:10.1098/rstb.2009.0267

Massimo Pigliucci

Genotype–phenotype mapping and the end of the ‘genes as blueprint’ metaphor

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:557-566; doi:10.1098/rstb.2009.0241

H. Frederik Nijhout, Derek A. Roff, and Goggy Davidowitz

Conflicting processes in the evolution of body size and development time

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:567-575; doi:10.1098/rstb.2009.0249

David W. Pfennig and Matthew McGee

Resource polyphenism increases species richness: a test of the hypothesis

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:577-591;

doi:10.1098/rstb.2009.0244

Armin P. Moczek

Phenotypic plasticity and diversity in insects

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:593-603; doi:10.1098/rstb.2009.0263

Jennifer A. Brisson

Aphid wing dimorphisms: linking environmental and genetic control of trait variation

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:605-616; doi:10.1098/rstb.2009.0255

Abderrahman Khila and Ehab Abouheif

Evaluating the role of reproductive constraints in ant social evolution

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:617-630; doi:10.1098/rstb.2009.0257

Alessandro Minelli and Giuseppe Fusco

Developmental plasticity and the evolution of animal complex life cycles

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:631-640; doi:10.1098/rstb.2009.0268

Sandie M. Degnan and Bernard M. Degnan

The initiation of metamorphosis as an ancient polyphenic trait and its role in metazoan life-cycle evolution

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:641-651; doi:10.1098/rstb.2009.0248

Cesar Arenas-Mena

Indirect development, transdifferentiation and the macroregulatory evolution of metazoans

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:653-669; doi:10.1098/rstb.2009.0253

Scott F. Gilbert, Emily McDonald, Nicole Boyle, Nicholas Buttino, Lin Gyi, Mark Mai, Neelakantan Prakash, and James Robinson

Symbiosis as a source of selectable epigenetic variation: taking the heat for the big guy

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:671-678; doi:10.1098/rstb.2009.0245

Alan C. Love

Idealization in evolutionary developmental investigation: a tension between phenotypic plasticity and normal stages

Phil. Trans. R. Soc. B February 27, 2010 365:679-690; doi:10.1098/rstb.2009.0262

23:37 | 論文 | posted by polyphenism

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heterokairy

2010.01.21 Thursday

毎朝，たいてい pod cast を聞きながら出勤するのですが，今週の nature pod cast で何やらaphid parasite worm の行動がどーのこーの言っていた．なので，調べてみると，もとネタは下記論文ということがわかった．

Muratoni FB, Borlee S, Messing RH (2010) Induced niche shift as an anti-predator response for an endoparasitoid. Proc R Roc B : doi:10.1098/rsbp.2009.2029

どうやら，アブラムシに寄生しているハエEndaphis fugitivaの幼虫は，アブラムシが補食されると何かを感じて，寄主の体から「脱出」するということである．このような緊急事態に脱出した幼虫は，早期に蛹になり，ちょっと小さめの成虫になるようだ．

動画が supplementary file となっています．下記が衝撃？の動画です．

確かに幼虫がウネウネ出てきてますね．

そして，脱出成功率は成熟個体ほど高いらしい．このように取り巻く環境の変化により発生のタイミングを調節することを "heterokairy" というようです．

Wikipediaによる定義はコチラ（以下は引用）．

In biology, heterokairy is used to define the variability or plasticity in the timing of the onset of developmental events 'at the level of an individual or population during development'. Physiological heterokairy, for example, would then refer specifically to plasticity in the timing of the onset of physiological regulatory systems or their components. Heterokairy derives from the Greek words Hetero meaning "different" and Kairois meaning "at the right time."

ヘテロクロニーにも似ていますが，2003年に定義された新しい言葉のようですね．

この報告は下記の記事でも取り上げられていました．

Parasitic escape: like rats from a sinking ship

（以下引用）

Larvae of a parasitic fly have learned to detect imminent danger to host organisms to flee for their lives. This kind of behavior has never been seen by scientists before.

Researchers have been studying the recently discovered fly called Endaphis fugitiva. During its life the tiny insect goes through a complete transformation cycle. At the larva stage it invades aphids and feeds on them before emerging and burying underground to become pupas. Such species, which live in their hosts only part-time, are called parasitoids, as compared to full-time parasites.

What makes the fly special is its ability to flee its host early, if the host comes under a predator attack, reports Nature magazine. The behavior was studied by a group of scientists led by Frederic Muratori, a behavioral ecologist at the Universite Catholique de Louvain in Belgiu

The team carried out two experiments using banana aphids. One group of aphids infected with E. fugitiva larvae was injured to imitate an attack while the other group was subjected to predator brown lacewings. In both cases the larvae fled the endangered host to save themselves.

The escapees managed to develop normally and become imago flies, although they were a little smaller than those who stayed in healthy hosts and spent slightly more time in the pupa stag.

It’s not clear yet how the parasitoid flies detect danger. They may do it by sensing stress factors in the host’s hemolymph, which gauges the mechanical pressure on the body.

アブラムシの寄生に関わる面白い話は他にも色々あるようですが，それはまたの機会に．

00:06 | 論文 | posted by polyphenism

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